Le temple de Santa María de la Asunción de Xemein date du Xe siècle, siècle de propagation du christianisme et de fondation de petits monastères. Jusqu’à la fondation de la ville de Markina (1355), les véritables patrons de ce monastère étaient les maisons de Barroeta et d’Ugarte, toutes deux de Xemein. Ces familles occupaient les meilleures places à l’église et touchaient une partie des dîmes qui y étaient versées. Au XIVe siècle (1355), lors de la fondation de la ville de Markina, il est dit dans sa charte de peuplement (ou charte fondatrice) que le monastère de Xemeingan serait commun au bourg de Xemein et à la ville de Markina. L’entrée de cette dernière dans la gestion du monastère coincida avec le début les controverses, les maisons de Barroeta et d’Ugarte prétendant assumer cette gestion dans son intégralité. Ces querelles poussèrent la ville à édifier l’église de San Pedro de Elizabarria. Les conflits liés au patronage du monastère subsistèrent par la suite. Au XVIIe siècle, la moitié du patronage bénéficiait à la ville de Markina et l’autre moitié aux maisons d’Ugarte et de Barroeta, un privilège dont hérita par la suite la maison de Peñaflorida.
L’édification de l’église de Xemein se poursuivit au XVIe siècle avec la participation des maîtres Martín Albisua, Rodrigo Albiz, Miguel Elorriaga, Juan Emasabel et du charpentier Pedro Andrino. Au XVIIe siècle furent construits les compléments du temple: le choeur, la sacristie et la tour-clocher. Le choeur abrite l’orgue (de 1910), oeuvre de la maison Amezua. En dessous du choeur se trouvent des représentations du Sacré-Coeur et de la Vierge du Rosaire. L’église de Xemein abrite également les sépulcres en pierre des familles Mugartegui et Peñaflorida, ainsi que la chapelle de Gaytán de Ayala, avec une Vierge du Pilar et un emblème de la famille sur la grille.
La sacristie primitive était située derrière le maître-autel, mais au XVIIe siècle, en raison de problèmes d’espace et d’humidité, on commença à construire la sacristie que nous connaissons aujourd’hui. À son édification prirent part les maîtres Gaspar Balzola, Martín Ibarluzea et Lucas Longa. La tour-clocher, quant à elle, commença à être érigée en 1625 par Juan de Urizar Zabala; néanmoins, son projet n’ayant pas plu, il dut personnellement mener à bien un projet concurrent présenté par Juan de Aguirre. C’est un clocher à deux corps, en pierre calcaire, surmonté d’un chapiteau et d’une croix.
Déclarée Monument National d’Euskadi, l’église est du type église-halle ou hallenkirche, si l’on utilise la dénomination allemande: elle suit un plan rectangulaire à trois nefs séparées par six colonnes en calcaire; les murs extérieurs sont en pierres calcaires de taille, alors que l’intérieur est recouvert d’un enduit; la voûte est sur croisée d’ogives étoilée avec courbures. L’église possède deux entrées: l’une, constituée d’un arc en plein cintre à voussoirs, sur la façade ouest, et l’entrée principale avec arc double et précédée d’un petit atrium, sur la façade sud. En ce qui concerne le contenu mobilier, on pourra admirer le retable principal de style Renaissance. Il a été réalisé dans la première moitié du XVIe siècle et est constitué d’une prédelle, quatre registres, trois travées et quatre encadrements à pilastres. C’est une oeuvre collective à laquelle ont sans doute contribué plusieurs artistes.